科學家開發了一種能夠實現表觀遺傳組-轉錄組聯合分析的新技術
發布時間:2023-04-07 14:35:53 | 來源:【中國生物技術發展中心 2023-4-6】
本文轉自中國生物技術發展中心,轉發僅為學習交流,若侵犯版權請聯系小編刪除。
單細胞多組學,尤其是染色質可及性表觀遺傳和轉錄組同時測序分析,不僅可以鑒別細胞類型和狀態,還可以揭示控制基因表達的機理,被視為單細胞組學分析的極致利器。而隨著空間組學的興起,空間多組學技術(spatial multi-omics)是否可以同時分析基因表達和基因調控機制,已成為全球矚目熱點,還曾被《Nature》雜志展望為2022年最值得期待的七項技術之一。
近期,美國耶魯大學和瑞典卡羅林斯卡學院的研究團隊開發了一項最新的空間多組學技術,成功實現了同一組織樣本上總體染色質可及性和基因表達的聯合空間組學分析(Spatial ATAC-RNA-seq),并同時報道了三種特定組蛋白修飾和基因表達的聯合分析(Spatial CUT&Tag-RNA-seq)。與單細胞數據整合分析顯示,這些技術達到了細胞水平或接近單細胞分辨率。該團隊希望后續將該技術應用于各種組織類型,并生成表觀遺傳和轉錄狀態的空間圖譜,以空間和全基因組水平為視角,深入探尋表觀遺傳機制在組織內掌控轉錄表型和細胞動態的奧秘。相關研究結果于2023年3月15日以“Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues”為題發表在《Nature》雜志上。
注:此研究成果摘自《Nature》,文章內容不代表本網站觀點和立場。